윈2000 이랑 리눅스 설치할때

안녕하세요

지금 하드가 2개입니다.

C: 15기가는 4기가를 리눅스를 먼저 깔았구 나머지 11기가를 fat32방식으로 98을 깔아서 쓰구 있습니다.
D:,E: 40기가는 확장영역으루 만들어서 논리 드라이브로 각각 20기가씩 쓰구 있습니다.

문제 없이 잘 돌았는데 윈98에다가 아파치 서버 깔구 깝치다가 - 누가 경고를 하긴 했는데.. -

완전 컴이 맛이 가서 C:를 포맷하구 다시 재 설치를 했는데.. 그래도 영 찝찝 합니다. 어짜피 리눅스는 안

건드려두 되는데.. - 리눅스를 먼저 설치하니까 편하더군요.. -

이제 2000을 깔려고 합니다. 그냥 아예 98을 안써버리구요..

그럼 ntfs의 파일 시스템이 되는데 c:를 ntsf로 포맷을 하려면 어떻게 해야 합니까? 전 98밖에 없으니까

이걸루 포맷하면 fat32 방식으루 밖에 안되는데요.. 2000 정품 시디로 부팅해서 포맷을 해야 합니까?

그리구 확장 영역인 d:,e: 도 역시 fat32 방식인데 이것을 ntfs로 포맷해야 합니까? 어짜피 데이타만 넣는

드라이브인데 꼭 파일 시스템을 바꿔주어야 하나요?

그리구 98이랑 리눅스는 같은 하드에 돌려도 전혀 문제가 없었는데 2000이랑 깔면 같은 드라이브에 같이

공존해도 상관없는지, 아니면 물리적으로 다른 하드에 설치하는 것이 안전한지 알고 싶습니다.

윈도가 하두 따운되서 미치겠습니다. 안정한 시스템을 구축하려고 생각합니다. 고수님들의 답변 기다리겠습니다.

fdisk나 각종 유틸들 쓰는 법은 거의 마스터 했습니다. 방법만 알려주시면 감사하겠습니다.